Vairuotojai gali rankiniu būdu reguliuoti automatinės pavarų dėžės santykius naudodami perjungiklius, kurie yra ant vairo ar kolonėlės pritvirtintos svirtys.
Daugelis automatinių pavarų dėžių turi rankinio perjungimo režimą, kurį galima pasirinkti pirmiausia perjungus ant konsolės esančią pavarų svirtį į rankinę padėtį. Tada vairuotojas gali rankiniu būdu pakeisti santykį, naudodamas ant vairo esančias mentes, o ne transmisijai tai padaryti už juos.
Vienas (dažnai dešinysis irklas) valdo pavarų perjungimą aukštyn, o kitas (dažniausiai kairioji irklas) – žemyn; kiekviena irklas vienu metu juda viena pavara. Mentelės paprastai yra abiejose vairo pusėse.